Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PKN1Q16512 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PKN1Q16512 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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