Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.39□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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CCDC6Q16204 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CCDC6Q16204 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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CCDC6Q16204 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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CCDC6Q16204 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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CCDC6Q16204 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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CCDC6Q16204 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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CCDC6Q16204 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CCDC6Q16204 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CCDC6Q16204 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CCDC6Q16204 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CCDC6Q16204 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CCDC6Q16204 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CCDC6Q16204 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CCDC6Q16204 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CCDC6Q16204 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CCDC6Q16204 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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