Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SURF1Q15526 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SURF1Q15526 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SURF1Q15526 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SURF1Q15526 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SURF1Q15526 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SURF1Q15526 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SURF1Q15526 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SURF1Q15526 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SURF1Q15526 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SURF1Q15526 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SURF1Q15526 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SURF1Q15526 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SURF1Q15526 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SURF1Q15526 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SURF1Q15526 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SURF1Q15526 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SURF1Q15526 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
SURF1Q15526 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SURF1Q15526 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SURF1Q15526 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SURF1Q15526 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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SURF1Q15526 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SURF1Q15526 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SURF1Q15526 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SURF1Q15526 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SURF1Q15526 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SURF1Q15526 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SURF1Q15526 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SURF1Q15526 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SURF1Q15526 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SURF1Q15526 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SURF1Q15526 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SURF1Q15526 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SURF1Q15526 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SURF1Q15526 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SURF1Q15526 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SURF1Q15526 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SURF1Q15526 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SURF1Q15526 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SURF1Q15526 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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