Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-3.71□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-3.72□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-3.72□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-3.76□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
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