Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCARF1Q14162 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCARF1Q14162 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCARF1Q14162 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCARF1Q14162 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCARF1Q14162 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SCARF1Q14162 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCARF1Q14162 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCARF1Q14162 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCARF1Q14162 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARF1Q14162 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SCARF1Q14162 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SCARF1Q14162 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCARF1Q14162 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCARF1Q14162 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SCARF1Q14162 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SCARF1Q14162 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
SCARF1Q14162 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCARF1Q14162 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCARF1Q14162 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
SCARF1Q14162 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SCARF1Q14162 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SCARF1Q14162 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARF1Q14162 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARF1Q14162 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARF1Q14162 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARF1Q14162 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SCARF1Q14162 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
SCARF1Q14162 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SCARF1Q14162 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCARF1Q14162 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCARF1Q14162 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCARF1Q14162 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCARF1Q14162 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCARF1Q14162 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCARF1Q14162 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCARF1Q14162 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCARF1Q14162 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCARF1Q14162 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCARF1Q14162 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCARF1Q14162 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCARF1Q14162 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCARF1Q14162 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCARF1Q14162 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCARF1Q14162 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SCARF1Q14162 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SCARF1Q14162 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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