Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.27□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CKAP5Q14008 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CKAP5Q14008 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CKAP5Q14008 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CKAP5Q14008 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CKAP5Q14008 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CKAP5Q14008 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CKAP5Q14008 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CKAP5Q14008 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CKAP5Q14008 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CKAP5Q14008 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CKAP5Q14008 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CKAP5Q14008 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CKAP5Q14008 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
CKAP5Q14008 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CKAP5Q14008 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CKAP5Q14008 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CKAP5Q14008 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CKAP5Q14008 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CKAP5Q14008 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CKAP5Q14008 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CKAP5Q14008 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CKAP5Q14008 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CKAP5Q14008 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CKAP5Q14008 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CKAP5Q14008 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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