Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.87□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
XRCC4Q13426 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
XRCC4Q13426 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.98□□□□□ -2.73
XRCC4Q13426 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
XRCC4Q13426 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
XRCC4Q13426 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
XRCC4Q13426 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
XRCC4Q13426 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
XRCC4Q13426 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
XRCC4Q13426 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
XRCC4Q13426 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
XRCC4Q13426 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
XRCC4Q13426 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.99□□□□□ -2.73
XRCC4Q13426 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
XRCC4Q13426 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
XRCC4Q13426 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
XRCC4Q13426 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
XRCC4Q13426 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
XRCC4Q13426 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
XRCC4Q13426 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
XRCC4Q13426 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
XRCC4Q13426 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
XRCC4Q13426 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
XRCC4Q13426 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
XRCC4Q13426 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.8 ms