Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
FOXD4Q12950 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FOXD4Q12950 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.4 ms