Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.17□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRAF2Q12933 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRAF2Q12933 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRAF2Q12933 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRAF2Q12933 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRAF2Q12933 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRAF2Q12933 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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