Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.43□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.6 ms