Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRXP46100 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRXP46100 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRXP46100 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRXP46100 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRXP46100 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRXP46100 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRXP46100 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRXP46100 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRXP46100 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRXP46100 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRXP46100 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRXP46100 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRXP46100 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRXP46100 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRXP46100 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRXP46100 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRXP46100 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRXP46100 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRXP46100 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRXP46100 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRXP46100 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRXP46100 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRXP46100 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRXP46100 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRXP46100 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRXP46100 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRXP46100 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRXP46100 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRXP46100 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRXP46100 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRXP46100 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRXP46100 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRXP46100 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRXP46100 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRXP46100 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRXP46100 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRXP46100 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRXP46100 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRXP46100 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRXP46100 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRXP46100 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRXP46100 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRXP46100 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRXP46100 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRXP46100 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRXP46100 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRXP46100 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRXP46100 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRXP46100 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRXP46100 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRXP46100 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRXP46100 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRXP46100 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRXP46100 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRXP46100 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRXP46100 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRXP46100 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRXP46100 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRXP46100 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRXP46100 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRXP46100 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRXP46100 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRXP46100 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRXP46100 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRXP46100 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRXP46100 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRXP46100 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRXP46100 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRXP46100 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRXP46100 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRXP46100 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRXP46100 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRXP46100 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRXP46100 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRXP46100 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRXP46100 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRXP46100 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRXP46100 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRXP46100 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRXP46100 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRXP46100 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRXP46100 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRXP46100 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRXP46100 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRXP46100 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRXP46100 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRXP46100 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRXP46100 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRXP46100 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRXP46100 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRXP46100 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRXP46100 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRXP46100 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRXP46100 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRXP46100 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRXP46100 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRXP46100 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRXP46100 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRXP46100 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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