Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-2.75□□□□□ -2.85
PTPRGP23470 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
PTPRGP23470 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
PTPRGP23470 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
PTPRGP23470 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
PTPRGP23470 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
PTPRGP23470 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
PTPRGP23470 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
PTPRGP23470 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
PTPRGP23470 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
PTPRGP23470 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
PTPRGP23470 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
PTPRGP23470 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
PTPRGP23470 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
PTPRGP23470 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
PTPRGP23470 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
PTPRGP23470 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
PTPRGP23470 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
PTPRGP23470 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
PTPRGP23470 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
PTPRGP23470 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.86
PTPRGP23470 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
PTPRGP23470 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
PTPRGP23470 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
PTPRGP23470 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
PTPRGP23470 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
PTPRGP23470 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
PTPRGP23470 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
PTPRGP23470 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
PTPRGP23470 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
PTPRGP23470 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
PTPRGP23470 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-2.87□□□□□ -2.87
PTPRGP23470 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
PTPRGP23470 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
PTPRGP23470 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
PTPRGP23470 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
PTPRGP23470 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-2.88□□□□□ -2.87
PTPRGP23470 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
PTPRGP23470 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
PTPRGP23470 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
PTPRGP23470 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
PTPRGP23470 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
PTPRGP23470 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
PTPRGP23470 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
PTPRGP23470 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
PTPRGP23470 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
PTPRGP23470 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
PTPRGP23470 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
PTPRGP23470 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
PTPRGP23470 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
PTPRGP23470 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
PTPRGP23470 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
PTPRGP23470 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
PTPRGP23470 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
PTPRGP23470 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
PTPRGP23470 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
PTPRGP23470 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
PTPRGP23470 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
PTPRGP23470 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
PTPRGP23470 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
PTPRGP23470 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
PTPRGP23470 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
PTPRGP23470 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
PTPRGP23470 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
PTPRGP23470 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
PTPRGP23470 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
PTPRGP23470 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
PTPRGP23470 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
PTPRGP23470 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms