Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.16□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-2.18□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-2.19□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
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