Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SPOCK3Q9BQ16 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPOCK3Q9BQ16 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPOCK3Q9BQ16 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SPOCK3Q9BQ16 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SPOCK3Q9BQ16 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SPOCK3Q9BQ16 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SPOCK3Q9BQ16 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SPOCK3Q9BQ16 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SPOCK3Q9BQ16 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SPOCK3Q9BQ16 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SPOCK3Q9BQ16 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SPOCK3Q9BQ16 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162 ms