Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
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PRRT1Q99946 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
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PRRT1Q99946 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PRRT1Q99946 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
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