Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PRPF18Q99633 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PRPF18Q99633 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PRPF18Q99633 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PRPF18Q99633 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PRPF18Q99633 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PRPF18Q99633 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PRPF18Q99633 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PRPF18Q99633 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PRPF18Q99633 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PRPF18Q99633 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PRPF18Q99633 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PRPF18Q99633 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PRPF18Q99633 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PRPF18Q99633 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PRPF18Q99633 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PRPF18Q99633 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PRPF18Q99633 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PRPF18Q99633 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PRPF18Q99633 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PRPF18Q99633 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PRPF18Q99633 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PRPF18Q99633 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
PRPF18Q99633 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PRPF18Q99633 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PRPF18Q99633 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PRPF18Q99633 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PRPF18Q99633 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PRPF18Q99633 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PRPF18Q99633 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PRPF18Q99633 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PRPF18Q99633 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PRPF18Q99633 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PRPF18Q99633 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PRPF18Q99633 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PRPF18Q99633 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PRPF18Q99633 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PRPF18Q99633 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PRPF18Q99633 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PRPF18Q99633 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PRPF18Q99633 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PRPF18Q99633 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
PRPF18Q99633 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PRPF18Q99633 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PRPF18Q99633 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PRPF18Q99633 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PRPF18Q99633 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PRPF18Q99633 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PRPF18Q99633 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PRPF18Q99633 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
PRPF18Q99633 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PRPF18Q99633 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PRPF18Q99633 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PRPF18Q99633 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PRPF18Q99633 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PRPF18Q99633 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PRPF18Q99633 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PRPF18Q99633 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PRPF18Q99633 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PRPF18Q99633 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PRPF18Q99633 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PRPF18Q99633 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PRPF18Q99633 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PRPF18Q99633 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PRPF18Q99633 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PRPF18Q99633 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PRPF18Q99633 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PRPF18Q99633 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PRPF18Q99633 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PRPF18Q99633 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PRPF18Q99633 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PRPF18Q99633 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PRPF18Q99633 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PRPF18Q99633 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PRPF18Q99633 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 266.9 ms