Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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ATG4CQ96DT6 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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ATG4CQ96DT6 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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ATG4CQ96DT6 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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ATG4CQ96DT6 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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ATG4CQ96DT6 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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ATG4CQ96DT6 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
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