Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ANKRD39Q53RE8 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ANKRD39Q53RE8 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.9 ms