Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TPRNQ4KMQ1 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TPRNQ4KMQ1 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TPRNQ4KMQ1 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.6□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TPRNQ4KMQ1 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TPRNQ4KMQ1 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TPRNQ4KMQ1 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TPRNQ4KMQ1 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TPRNQ4KMQ1 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TPRNQ4KMQ1 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TPRNQ4KMQ1 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TPRNQ4KMQ1 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TPRNQ4KMQ1 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TPRNQ4KMQ1 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TPRNQ4KMQ1 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TPRNQ4KMQ1 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TPRNQ4KMQ1 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TPRNQ4KMQ1 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TPRNQ4KMQ1 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TPRNQ4KMQ1 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TPRNQ4KMQ1 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TPRNQ4KMQ1 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TPRNQ4KMQ1 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TPRNQ4KMQ1 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TPRNQ4KMQ1 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TPRNQ4KMQ1 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TPRNQ4KMQ1 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TPRNQ4KMQ1 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TPRNQ4KMQ1 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TPRNQ4KMQ1 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TPRNQ4KMQ1 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TPRNQ4KMQ1 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TPRNQ4KMQ1 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TPRNQ4KMQ1 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TPRNQ4KMQ1 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TPRNQ4KMQ1 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TPRNQ4KMQ1 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TPRNQ4KMQ1 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TPRNQ4KMQ1 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TPRNQ4KMQ1 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TPRNQ4KMQ1 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TPRNQ4KMQ1 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TPRNQ4KMQ1 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TPRNQ4KMQ1 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TPRNQ4KMQ1 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TPRNQ4KMQ1 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TPRNQ4KMQ1 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TPRNQ4KMQ1 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TPRNQ4KMQ1 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TPRNQ4KMQ1 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TPRNQ4KMQ1 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TPRNQ4KMQ1 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TPRNQ4KMQ1 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TPRNQ4KMQ1 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TPRNQ4KMQ1 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TPRNQ4KMQ1 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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