Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
FXNQ16595 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
FXNQ16595 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
FXNQ16595 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
FXNQ16595 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
FXNQ16595 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
FXNQ16595 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
FXNQ16595 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
FXNQ16595 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
FXNQ16595 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
FXNQ16595 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
FXNQ16595 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
FXNQ16595 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
FXNQ16595 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
FXNQ16595 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
FXNQ16595 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
FXNQ16595 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
FXNQ16595 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
FXNQ16595 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
FXNQ16595 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
FXNQ16595 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
FXNQ16595 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
FXNQ16595 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
FXNQ16595 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
FXNQ16595 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
FXNQ16595 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
FXNQ16595 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
FXNQ16595 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
FXNQ16595 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
FXNQ16595 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
FXNQ16595 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
FXNQ16595 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
FXNQ16595 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
FXNQ16595 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
FXNQ16595 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
FXNQ16595 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
FXNQ16595 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FXNQ16595 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FXNQ16595 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FXNQ16595 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FXNQ16595 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FXNQ16595 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FXNQ16595 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FXNQ16595 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FXNQ16595 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FXNQ16595 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FXNQ16595 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FXNQ16595 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FXNQ16595 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FXNQ16595 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FXNQ16595 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FXNQ16595 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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FXNQ16595 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FXNQ16595 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FXNQ16595 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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FXNQ16595 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FXNQ16595 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FXNQ16595 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FXNQ16595 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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FXNQ16595 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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FXNQ16595 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
FXNQ16595 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
FXNQ16595 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
FXNQ16595 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
FXNQ16595 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
FXNQ16595 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
FXNQ16595 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
FXNQ16595 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
FXNQ16595 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
FXNQ16595 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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FXNQ16595 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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FXNQ16595 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.3□□□□□ -2.36
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FXNQ16595 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
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FXNQ16595 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
FXNQ16595 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
FXNQ16595 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
FXNQ16595 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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FXNQ16595 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
FXNQ16595 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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