Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
ALX1Q15699 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
ALX1Q15699 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-2.84□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ALX1Q15699 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
ALX1Q15699 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
ALX1Q15699 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
ALX1Q15699 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
ALX1Q15699 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
ALX1Q15699 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
ALX1Q15699 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
ALX1Q15699 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
ALX1Q15699 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ALX1Q15699 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ALX1Q15699 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ALX1Q15699 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ALX1Q15699 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ALX1Q15699 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ALX1Q15699 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ALX1Q15699 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ALX1Q15699 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ALX1Q15699 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
ALX1Q15699 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.6 ms