Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SHHQ15465 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SHHQ15465 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHHQ15465 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHHQ15465 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHHQ15465 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHHQ15465 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHHQ15465 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHHQ15465 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHHQ15465 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHHQ15465 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHHQ15465 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHHQ15465 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHHQ15465 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHHQ15465 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHHQ15465 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHHQ15465 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHHQ15465 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHHQ15465 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHHQ15465 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHHQ15465 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHHQ15465 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHHQ15465 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHHQ15465 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHHQ15465 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHHQ15465 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHHQ15465 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHHQ15465 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHHQ15465 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHHQ15465 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHHQ15465 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHHQ15465 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHHQ15465 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHHQ15465 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHHQ15465 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHHQ15465 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHHQ15465 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHHQ15465 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHHQ15465 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHHQ15465 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHHQ15465 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHHQ15465 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHHQ15465 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHHQ15465 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHHQ15465 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHHQ15465 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHHQ15465 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHHQ15465 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHHQ15465 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHHQ15465 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHHQ15465 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHHQ15465 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHHQ15465 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHHQ15465 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHHQ15465 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHHQ15465 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHHQ15465 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHHQ15465 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHHQ15465 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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SHHQ15465 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SHHQ15465 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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SHHQ15465 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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SHHQ15465 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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SHHQ15465 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHHQ15465 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHHQ15465 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHHQ15465 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHHQ15465 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHHQ15465 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHHQ15465 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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