Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.67□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.71□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PDE6HQ13956 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
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