Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
GTF2H3Q13889 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GTF2H3Q13889 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GTF2H3Q13889 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GTF2H3Q13889 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GTF2H3Q13889 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GTF2H3Q13889 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GTF2H3Q13889 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GTF2H3Q13889 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GTF2H3Q13889 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GTF2H3Q13889 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GTF2H3Q13889 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GTF2H3Q13889 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GTF2H3Q13889 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
GTF2H3Q13889 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF2H3Q13889 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GTF2H3Q13889 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GTF2H3Q13889 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GTF2H3Q13889 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GTF2H3Q13889 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GTF2H3Q13889 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GTF2H3Q13889 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GTF2H3Q13889 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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