Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMAD4Q13485 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMAD4Q13485 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMAD4Q13485 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
SMAD4Q13485 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMAD4Q13485 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMAD4Q13485 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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