Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SF3B2Q13435 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SF3B2Q13435 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SF3B2Q13435 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SF3B2Q13435 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SF3B2Q13435 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
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