Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ITGB3BPQ13352 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ITGB3BPQ13352 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ITGB3BPQ13352 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ITGB3BPQ13352 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ITGB3BPQ13352 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ITGB3BPQ13352 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ITGB3BPQ13352 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ITGB3BPQ13352 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-2.55□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.61□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ITGB3BPQ13352 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.8 ms