Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SEMA3FQ13275 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SEMA3FQ13275 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SEMA3FQ13275 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SEMA3FQ13275 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SEMA3FQ13275 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SEMA3FQ13275 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SEMA3FQ13275 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SEMA3FQ13275 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SEMA3FQ13275 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SEMA3FQ13275 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SEMA3FQ13275 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SEMA3FQ13275 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SEMA3FQ13275 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SEMA3FQ13275 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SEMA3FQ13275 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SEMA3FQ13275 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SEMA3FQ13275 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SEMA3FQ13275 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SEMA3FQ13275 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SEMA3FQ13275 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEMA3FQ13275 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEMA3FQ13275 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEMA3FQ13275 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEMA3FQ13275 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SEMA3FQ13275 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEMA3FQ13275 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEMA3FQ13275 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEMA3FQ13275 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEMA3FQ13275 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEMA3FQ13275 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEMA3FQ13275 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SEMA3FQ13275 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SEMA3FQ13275 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SEMA3FQ13275 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SEMA3FQ13275 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SEMA3FQ13275 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SEMA3FQ13275 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SEMA3FQ13275 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SEMA3FQ13275 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SEMA3FQ13275 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SEMA3FQ13275 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.6 ms