Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CBX3Q13185 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CBX3Q13185 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CBX3Q13185 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CBX3Q13185 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CBX3Q13185 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CBX3Q13185 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CBX3Q13185 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CBX3Q13185 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CBX3Q13185 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
CBX3Q13185 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CBX3Q13185 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CBX3Q13185 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CBX3Q13185 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CBX3Q13185 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CBX3Q13185 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CBX3Q13185 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CBX3Q13185 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CBX3Q13185 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CBX3Q13185 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CBX3Q13185 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CBX3Q13185 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CBX3Q13185 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CBX3Q13185 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CBX3Q13185 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CBX3Q13185 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CBX3Q13185 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CBX3Q13185 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CBX3Q13185 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CBX3Q13185 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CBX3Q13185 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CBX3Q13185 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CBX3Q13185 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CBX3Q13185 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CBX3Q13185 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CBX3Q13185 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CBX3Q13185 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CBX3Q13185 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CBX3Q13185 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CBX3Q13185 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CBX3Q13185 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
CBX3Q13185 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CBX3Q13185 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CBX3Q13185 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CBX3Q13185 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.5 ms