Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
PTPN13Q12923 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
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