Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
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RAB40BQ12829 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RAB40BQ12829 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
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RAB40BQ12829 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
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RAB40BQ12829 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
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RAB40BQ12829 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.88□□□□□ -2.55
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RAB40BQ12829 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
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RAB40BQ12829 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
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RAB40BQ12829 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
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RAB40BQ12829 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
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RAB40BQ12829 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RAB40BQ12829 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RAB40BQ12829 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
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