Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RAB40BQ12829 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RAB40BQ12829 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RAB40BQ12829 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RAB40BQ12829 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RAB40BQ12829 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.88□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
RAB40BQ12829 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
RAB40BQ12829 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
RAB40BQ12829 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
RAB40BQ12829 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
RAB40BQ12829 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
RAB40BQ12829 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
RAB40BQ12829 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
RAB40BQ12829 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
RAB40BQ12829 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
RAB40BQ12829 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
RAB40BQ12829 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RAB40BQ12829 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RAB40BQ12829 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RAB40BQ12829 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RAB40BQ12829 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RAB40BQ12829 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RAB40BQ12829 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms