Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IRF9Q00978 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
IRF9Q00978 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
IRF9Q00978 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
IRF9Q00978 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
IRF9Q00978 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
IRF9Q00978 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
IRF9Q00978 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
IRF9Q00978 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
IRF9Q00978 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
IRF9Q00978 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
IRF9Q00978 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
IRF9Q00978 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.57□□□□□ -2.32
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IRF9Q00978 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
IRF9Q00978 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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IRF9Q00978 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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IRF9Q00978 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IRF9Q00978 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
IRF9Q00978 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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IRF9Q00978 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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IRF9Q00978 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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IRF9Q00978 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
IRF9Q00978 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
IRF9Q00978 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
IRF9Q00978 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
IRF9Q00978 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
IRF9Q00978 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
IRF9Q00978 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
IRF9Q00978 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
IRF9Q00978 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
IRF9Q00978 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
IRF9Q00978 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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