Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LTBRP36941 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LTBRP36941 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LTBRP36941 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LTBRP36941 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LTBRP36941 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LTBRP36941 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
LTBRP36941 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LTBRP36941 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LTBRP36941 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LTBRP36941 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LTBRP36941 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LTBRP36941 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LTBRP36941 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LTBRP36941 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LTBRP36941 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LTBRP36941 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LTBRP36941 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LTBRP36941 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LTBRP36941 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LTBRP36941 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LTBRP36941 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LTBRP36941 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LTBRP36941 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LTBRP36941 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LTBRP36941 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LTBRP36941 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LTBRP36941 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LTBRP36941 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LTBRP36941 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
LTBRP36941 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
LTBRP36941 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
LTBRP36941 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
LTBRP36941 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
LTBRP36941 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LTBRP36941 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LTBRP36941 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LTBRP36941 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LTBRP36941 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LTBRP36941 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LTBRP36941 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LTBRP36941 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LTBRP36941 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LTBRP36941 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
LTBRP36941 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
LTBRP36941 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
LTBRP36941 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
LTBRP36941 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
LTBRP36941 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LTBRP36941 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LTBRP36941 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LTBRP36941 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LTBRP36941 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
LTBRP36941 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
LTBRP36941 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
LTBRP36941 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
LTBRP36941 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
LTBRP36941 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
LTBRP36941 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
LTBRP36941 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
LTBRP36941 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
LTBRP36941 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
LTBRP36941 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
LTBRP36941 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
LTBRP36941 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
LTBRP36941 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
LTBRP36941 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LTBRP36941 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LTBRP36941 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LTBRP36941 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LTBRP36941 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LTBRP36941 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
LTBRP36941 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
LTBRP36941 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LTBRP36941 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LTBRP36941 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LTBRP36941 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LTBRP36941 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LTBRP36941 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LTBRP36941 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LTBRP36941 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LTBRP36941 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
LTBRP36941 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
LTBRP36941 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
LTBRP36941 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.62□□□□□ -2.31
LTBRP36941 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
LTBRP36941 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
LTBRP36941 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
LTBRP36941 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
LTBRP36941 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
LTBRP36941 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LTBRP36941 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LTBRP36941 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LTBRP36941 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LTBRP36941 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LTBRP36941 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LTBRP36941 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LTBRP36941 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LTBRP36941 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LTBRP36941 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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