Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD11P31277 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD11P31277 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD11P31277 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD11P31277 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD11P31277 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD11P31277 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD11P31277 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD11P31277 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD11P31277 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD11P31277 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD11P31277 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD11P31277 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD11P31277 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD11P31277 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD11P31277 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD11P31277 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD11P31277 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD11P31277 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD11P31277 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD11P31277 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD11P31277 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD11P31277 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD11P31277 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD11P31277 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD11P31277 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD11P31277 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD11P31277 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD11P31277 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD11P31277 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD11P31277 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD11P31277 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD11P31277 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD11P31277 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD11P31277 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD11P31277 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD11P31277 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD11P31277 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD11P31277 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD11P31277 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
HOXD11P31277 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD11P31277 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD11P31277 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD11P31277 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD11P31277 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD11P31277 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD11P31277 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD11P31277 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD11P31277 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD11P31277 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD11P31277 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD11P31277 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD11P31277 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD11P31277 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD11P31277 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD11P31277 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD11P31277 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD11P31277 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD11P31277 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD11P31277 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD11P31277 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD11P31277 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD11P31277 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD11P31277 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD11P31277 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD11P31277 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD11P31277 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD11P31277 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD11P31277 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD11P31277 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD11P31277 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD11P31277 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD11P31277 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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