Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, human

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene	UniProt Accession	Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF1	P21675	RNU6-815P-201	ENST00000384080	113 nt	BASIC	0.12	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	RNA5SP484-201	ENST00000458857	111 nt	BASIC	0.12	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	RNU7-24P-201	ENST00000458867	62 nt	BASIC	0.12	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	RNU6-162P-201	ENST00000516228	103 nt	BASIC	0.12	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	MIR4473-201	ENST00000583731	91 nt	BASIC	0.12	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	U7.6-201	ENST00000610841	64 nt	BASIC	0.12	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	Y_RNA.371-201	ENST00000365591	113 nt	BASIC	0.12	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	Y_RNA.495-201	ENST00000384435	112 nt	BASIC	0.12	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	MIR1295A-201	ENST00000408463	79 nt	BASIC	0.12	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	snoU13.17-201	ENST00000458802	104 nt	BASIC	0.12	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	RNU6-495P-201	ENST00000362995	107 nt	BASIC	0.11	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	RNU6-681P-201	ENST00000364012	104 nt	BASIC	0.11	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	SNORD114-29-201	ENST00000364819	70 nt	BASIC	0.11	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	RNU6-1131P-201	ENST00000364955	107 nt	BASIC	0.11	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	RNU6-1051P-201	ENST00000365471	102 nt	BASIC	0.11	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	AC084368.1-201	ENST00000620935	65 nt	BASIC	0.11	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	SNORD115-27-201	ENST00000364430	82 nt	BASIC	0.1	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	TRAJ61-201	ENST00000390479	60 nt	APPRIS P1 BASIC	0.1	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	RNU6-1177P-201	ENST00000391058	104 nt	BASIC	0.1	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	RNU6ATAC11P-201	ENST00000408541	125 nt	BASIC	0.1	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	RNA5SP25-201	ENST00000410815	110 nt	BASIC	0.1	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	RN7SKP12-201	ENST00000516275	143 nt	BASIC	0.1	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	SNORA18.5-201	ENST00000516616	101 nt	BASIC	0.1	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	SNORA42.1-201	ENST00000363515	137 nt	BASIC	0.1	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	MIR106A-201	ENST00000384870	81 nt	BASIC	0.1	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	Y_RNA.609-201	ENST00000410669	89 nt	BASIC	0.1	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	RNU6-1232P-201	ENST00000516299	86 nt	BASIC	0.1	□□□□□ -2.39
TAF1	P21675	RNU6-168P-201	ENST00000516189	101 nt	BASIC	0.09	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	MIR4460-201	ENST00000577862	86 nt	BASIC	0.08	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	RNA5SP98-201	ENST00000363158	137 nt	BASIC	0.07	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	RNU6-46P-201	ENST00000383860	107 nt	BASIC	0.07	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	MIR145-201	ENST00000384967	88 nt	BASIC	0.07	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	IL6ST-207	ENST00000396816	168 nt	TSL 1 (best) BASIC	0.07	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	MIR1265-201	ENST00000408444	86 nt	BASIC	0.07	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	MIR4796-201	ENST00000580742	81 nt	BASIC	0.07	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	MIR548O2-201	ENST00000616090	70 nt	BASIC	0.07	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	MALAT1.1-201	ENST00000618249	95 nt	BASIC	0.07	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	SCARNA17.3-201	ENST00000516381	125 nt	BASIC	0.07	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	AC026421.1-201	ENST00000519101	163 nt	BASIC	0.07	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	CR383656.4-201	ENST00000546909	122 nt	BASIC	0.07	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	MIR4752-201	ENST00000579672	72 nt	BASIC	0.07	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	Y_RNA.620-201	ENST00000411009	88 nt	BASIC	0.06	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	RNU7-188P-201	ENST00000517063	64 nt	BASIC	0.06	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	RNU5F-1-201	ENST00000362507	117 nt	BASIC	0.05	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	RNA5SP163-201	ENST00000410304	99 nt	BASIC	0.05	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	MIR3064-201	ENST00000581130	66 nt	BASIC	0.05	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	SNORD114-16-201	ENST00000363044	70 nt	BASIC	0.05	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	RNY1P1-201	ENST00000364372	112 nt	BASIC	0.05	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	Y_RNA.437-201	ENST00000384113	113 nt	BASIC	0.05	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	RNU6-633P-201	ENST00000362612	103 nt	BASIC	0.04	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	RNU6-640P-201	ENST00000363693	105 nt	BASIC	0.04	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	SNORD114-12-201	ENST00000365400	75 nt	BASIC	0.03	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	MIR6509-201	ENST00000614603	85 nt	BASIC	0.03	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	Clostridiales-1.4-201	ENST00000636807	150 nt	BASIC	0.03	□□□□□ -2.4
TAF1	P21675	MIR450A2-201	ENST00000385022	100 nt	BASIC	0.03	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	RNU6-180P-201	ENST00000516697	61 nt	BASIC	0.03	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	YWHAEP3-201	ENST00000582767	121 nt	BASIC	0.03	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	MIR4290-201	ENST00000583807	95 nt	BASIC	0.03	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	Y_RNA.611-201	ENST00000410682	108 nt	BASIC	0.02	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	NAMPTP3-201	ENST00000569273	224 nt	BASIC	0.02	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	RNU6-294P-201	ENST00000364999	102 nt	BASIC	0.01	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	AL691482.2-201	ENST00000457453	84 nt	BASIC	0.01	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	RNU7-165P-201	ENST00000458864	60 nt	BASIC	0.01	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	MIR3140-201	ENST00000583685	90 nt	BASIC	0.01	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	DLEU2_3.2-201	ENST00000612883	73 nt	BASIC	0.01	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	Y_RNA.407-201	ENST00000383986	113 nt	BASIC	0.01	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	RNU6-675P-201	ENST00000384236	104 nt	BASIC	0.01	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	SNORD75.2-201	ENST00000408784	58 nt	BASIC	0.01	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	RNU6-274P-201	ENST00000459566	107 nt	BASIC	0.01	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	RNU6-267P-201	ENST00000516714	103 nt	BASIC	0.01	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	AC140658.3-201	ENST00000567603	271 nt	BASIC	0.01	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	SNORD114-5-201	ENST00000362928	70 nt	BASIC	0	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	RNU6-979P-201	ENST00000383896	107 nt	BASIC	0	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	RNU6-154P-201	ENST00000384306	106 nt	BASIC	0	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	RNU6-844P-201	ENST00000517175	102 nt	BASIC	0	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	MIR1295B-201	ENST00000636144	60 nt	BASIC	0	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	RNU6-175P-201	ENST00000516896	107 nt	BASIC	-0.01	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	MIR6739-201	ENST00000622461	75 nt	BASIC	-0.01	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	RNU6-929P-201	ENST00000384429	107 nt	BASIC	-0.01	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	RNY1P7-201	ENST00000384743	110 nt	BASIC	-0.01	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	RNU6-127P-201	ENST00000390897	107 nt	BASIC	-0.01	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	SNORA25.13-201	ENST00000516395	103 nt	BASIC	-0.01	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	Y_RNA.81-201	ENST00000362997	102 nt	BASIC	-0.02	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	RNU6-54P-201	ENST00000365563	107 nt	BASIC	-0.02	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	RNU6-49P-201	ENST00000384256	107 nt	BASIC	-0.02	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	MIR4668-201	ENST00000582284	70 nt	BASIC	-0.02	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	RN7SL660P-201	ENST00000614852	299 nt	BASIC	-0.02	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	Y_RNA.558-201	ENST00000384685	113 nt	BASIC	-0.03	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	AC104692.1-201	ENST00000472406	90 nt	BASIC	-0.03	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	AL627230.5-201	ENST00000619807	58 nt	BASIC	-0.03	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	Z95118.1-201	ENST00000421372	247 nt	BASIC	-0.03	□□□□□ -2.41
TAF1	P21675	MIR203A-201	ENST00000384836	110 nt	BASIC	-0.04	□□□□□ -2.42
TAF1	P21675	MIR5582-201	ENST00000579697	68 nt	BASIC	-0.04	□□□□□ -2.42
TAF1	P21675	MIR4768-201	ENST00000585270	74 nt	BASIC	-0.04	□□□□□ -2.42
TAF1	P21675	AC104996.3-201	ENST00000590718	94 nt	BASIC	-0.04	□□□□□ -2.42
TAF1	P21675	MIR1297-201	ENST00000637311	77 nt	BASIC	-0.04	□□□□□ -2.42
TAF1	P21675	RNU6-161P-201	ENST00000363051	106 nt	BASIC	-0.05	□□□□□ -2.42
TAF1	P21675	RNA5SP368-201	ENST00000364298	116 nt	BASIC	-0.05	□□□□□ -2.42
TAF1	P21675	SNORA24B-201	ENST00000384176	131 nt	BASIC	-0.05	□□□□□ -2.42
TAF1	P21675	TRAJ37-201	ENST00000612375	65 nt	APPRIS P1 BASIC	-0.05	□□□□□ -2.42

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