Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CLDN9O95484 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CLDN9O95484 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.26□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CLDN9O95484 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
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