Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
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