Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MEIS3Q99687 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212 ms