Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.62□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C9orf47Q6ZRZ4 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.8 ms