Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDK4Q16654 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
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PDK4Q16654 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
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PDK4Q16654 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
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PDK4Q16654 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
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PDK4Q16654 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
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PDK4Q16654 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
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PDK4Q16654 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PDK4Q16654 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PDK4Q16654 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PDK4Q16654 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PDK4Q16654 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PDK4Q16654 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PDK4Q16654 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PDK4Q16654 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PDK4Q16654 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PDK4Q16654 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PDK4Q16654 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.31□□□□□ -2.62
PDK4Q16654 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PDK4Q16654 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PDK4Q16654 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PDK4Q16654 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PDK4Q16654 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PDK4Q16654 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PDK4Q16654 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PDK4Q16654 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PDK4Q16654 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PDK4Q16654 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PDK4Q16654 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
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