Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PKN1Q16512 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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