Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
E2F4Q16254 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
E2F4Q16254 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
E2F4Q16254 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
E2F4Q16254 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
E2F4Q16254 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
E2F4Q16254 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
E2F4Q16254 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
E2F4Q16254 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
E2F4Q16254 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
E2F4Q16254 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
E2F4Q16254 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
E2F4Q16254 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
E2F4Q16254 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
E2F4Q16254 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
E2F4Q16254 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
E2F4Q16254 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
E2F4Q16254 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
E2F4Q16254 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
E2F4Q16254 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
E2F4Q16254 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
E2F4Q16254 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
E2F4Q16254 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
E2F4Q16254 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
E2F4Q16254 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
E2F4Q16254 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
E2F4Q16254 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
E2F4Q16254 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
E2F4Q16254 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
E2F4Q16254 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
E2F4Q16254 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
E2F4Q16254 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
E2F4Q16254 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
E2F4Q16254 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
E2F4Q16254 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
E2F4Q16254 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
E2F4Q16254 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
E2F4Q16254 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
E2F4Q16254 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
E2F4Q16254 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
E2F4Q16254 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
E2F4Q16254 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
E2F4Q16254 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
E2F4Q16254 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
E2F4Q16254 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
E2F4Q16254 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
E2F4Q16254 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
E2F4Q16254 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
E2F4Q16254 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
E2F4Q16254 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
E2F4Q16254 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
E2F4Q16254 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
E2F4Q16254 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
E2F4Q16254 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
E2F4Q16254 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
E2F4Q16254 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
E2F4Q16254 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
E2F4Q16254 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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