Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-2.19□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-2.21□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
NEDD8Q15843 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.24□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
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NEDD8Q15843 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
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NEDD8Q15843 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
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NEDD8Q15843 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
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NEDD8Q15843 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
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NEDD8Q15843 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
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NEDD8Q15843 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
NEDD8Q15843 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
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