Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKIV2LQ15477 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKIV2LQ15477 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SKIV2LQ15477 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKIV2LQ15477 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKIV2LQ15477 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKIV2LQ15477 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKIV2LQ15477 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKIV2LQ15477 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKIV2LQ15477 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKIV2LQ15477 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKIV2LQ15477 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKIV2LQ15477 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKIV2LQ15477 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKIV2LQ15477 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKIV2LQ15477 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SKIV2LQ15477 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKIV2LQ15477 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKIV2LQ15477 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SKIV2LQ15477 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SKIV2LQ15477 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SKIV2LQ15477 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SKIV2LQ15477 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SKIV2LQ15477 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SKIV2LQ15477 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKIV2LQ15477 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKIV2LQ15477 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKIV2LQ15477 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SKIV2LQ15477 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SKIV2LQ15477 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SKIV2LQ15477 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SKIV2LQ15477 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SKIV2LQ15477 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SKIV2LQ15477 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKIV2LQ15477 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKIV2LQ15477 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKIV2LQ15477 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SKIV2LQ15477 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKIV2LQ15477 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SKIV2LQ15477 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SKIV2LQ15477 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKIV2LQ15477 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKIV2LQ15477 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKIV2LQ15477 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKIV2LQ15477 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKIV2LQ15477 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKIV2LQ15477 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SKIV2LQ15477 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SKIV2LQ15477 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SKIV2LQ15477 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SKIV2LQ15477 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SKIV2LQ15477 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SKIV2LQ15477 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SKIV2LQ15477 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SKIV2LQ15477 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SKIV2LQ15477 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SKIV2LQ15477 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SKIV2LQ15477 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SKIV2LQ15477 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SKIV2LQ15477 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SKIV2LQ15477 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SKIV2LQ15477 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SKIV2LQ15477 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SKIV2LQ15477 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SKIV2LQ15477 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SKIV2LQ15477 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SKIV2LQ15477 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SKIV2LQ15477 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SKIV2LQ15477 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SKIV2LQ15477 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SKIV2LQ15477 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SKIV2LQ15477 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SKIV2LQ15477 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SKIV2LQ15477 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SKIV2LQ15477 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SKIV2LQ15477 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SKIV2LQ15477 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SKIV2LQ15477 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SKIV2LQ15477 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SKIV2LQ15477 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SKIV2LQ15477 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SKIV2LQ15477 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SKIV2LQ15477 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SKIV2LQ15477 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SKIV2LQ15477 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SKIV2LQ15477 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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