Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-2.02□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SYCP1Q15431 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
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SYCP1Q15431 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-2.06□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
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SYCP1Q15431 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SYCP1Q15431 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
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SYCP1Q15431 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-2.13□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
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