Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CAPRIN1Q14444 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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