Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERV3-1Q14264 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ERV3-1Q14264 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERV3-1Q14264 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERV3-1Q14264 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERV3-1Q14264 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERV3-1Q14264 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERV3-1Q14264 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ERV3-1Q14264 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
ERV3-1Q14264 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERV3-1Q14264 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERV3-1Q14264 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERV3-1Q14264 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERV3-1Q14264 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ERV3-1Q14264 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms