Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CKAP5Q14008 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CKAP5Q14008 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CKAP5Q14008 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CKAP5Q14008 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CKAP5Q14008 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CKAP5Q14008 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CKAP5Q14008 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CKAP5Q14008 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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