Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDE6HQ13956 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.54□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PDE6HQ13956 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PDE6HQ13956 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
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