Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ALCAMQ13740 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ALCAMQ13740 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
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ALCAMQ13740 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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ALCAMQ13740 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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